空间转录组Seurat分析手册1、课程简介继《手把手教你做单细胞》之后我们正式推出第二个系列《空间转录组保姆级教程》本系列视频将为大家提供空间转录组测序数据分析的完备方案本次内容基于Seurat进行空转数据分析基础操作的演示最大限度的让我们学习R语言单细胞的用户能够快速的迁移学习空转分析。课程内容将持续更新(基于Gitto的教程已在制作中啦~)。视频可在全平台观看B站(已更五集)https://www.bilibili.com/video/BV181wezqEgK/小红书http://xhslink.com/o/39Scgv66i0G抖音https://v.douyin.com/GJGmDLUluig/2、空间转录组介绍空间转录组Spatial Transcriptomics, ST是在保留组织原位空间位置的前提下同时获取全基因组基因表达信息的技术解决了传统 bulk 测序丢失异质性、单细胞测序丢失空间位置的痛点还具有解析组织微环境中细胞互作机制离的核心优势。这一技术出现为高通量测序加上了空间的坐标信息这是一场新的革命为神经科学、发育学、植物学、病理学等领域提供了强有力的研究手段。我们在2023订阅、2024龙年订阅、2025订阅也更新不少关于空转的内容现除了提供资料还手把手教大家学会空间转录组。资料课表学习资料图片集锦本次课程的学习资料可以联系Biomamba_zhushou领取空间转录组保姆级教程内容1. 空间转录组绪论2. Visium介绍3. Seurat空间转录组分析手册Visium为例3.1 Seurat简介3.2 10X Visium分析流程演示3.2.1 数据结构与读取3.2.1.1 Seurat测试数据下载3.2.1.2 数据结构3.2.1.3 一键抓取3.2.2 基础分析3.2.2.1 标准化3.2.2.2 基因表达量可视化3.2.2.3 降维、聚类、可视化3.2.2.4 交互式可视化3.2.2.5 计算空间高变基因3.2.2.6 取出特定的解剖学区域3.2.3 整合分析3.2.3.1 单细胞数据的整合3.2.3.2 多玻片空转数据处理4. 更多空间转录组教程5. 欢迎致谢往期推送Biomamba 生信基地现已开放终身订阅现已包含几十篇订阅资料未来37年持续更新为什么我们敢开放终身订阅2025年我们零差评完成订阅任务2026订阅须知2026已更新订阅内容单细胞Figure1的常见图表(Python版)告别R依赖一文搞定Python单细胞基础分析风靡一时的scTenifoldKnk单细胞虚拟基因敲除,准不准?scRNA拟时序分析三大Python包 palantir、PAGA、RNAvelocity正刊都在用的AI驱动蛋白质从头设计流程RFdiffusionProteinMPNNAlphaFold3CellphoneDB搞定细胞通讯分析scRNA-seq肿瘤细胞药物敏感性预测分析fastXXX、rapidXXX系列加速你的单细胞数据分析转录因子、基因共表达网络分析手册pySCENIC在脑、黑色素瘤中的应用让你的scRNA数据变得更干净~持续更新中~解锁前需阅读2026订阅须知