用 MOE 2024.0601 将 Cys 与 CL2A–SN-38 做 Michael 加成时Combinatorial Library 显示 C20产物数也为0。检查三维结构maleimide 的双键和两个羰基都正常。排查 MDB 和界面源码后发现输入有203个原子其中106个是重原子。combitools_ui.svl 设置 MAX_INPUT_ATOMS150仅接受原子数小于150的记录显式氢也计入因此分子在匹配前就被跳过界面却没有提示超限。解决方法保留原库另存去除显式氢的输入 MDB。原子数降至106前后提取的含手性 SMILES 完全一致MOE 在反应匹配时自动加氢测试已能匹配受体。遇到 C20除了检查字段和反应位点也应检查保存的总原子数。该规则可能匹配多个位置生成后仍要核对 Cys 是否连接到 maleimide。